طبقه بندی نوع و میزبان در ویروس آنفولانزا از روی توالی های ویروس

thesis
abstract

داده کاوی علم استخراج اطلاعات ضمنی، از قبل ناشناخته و به صورت بالقوه مفید از داده های خام است. کاربرد داده کاوی در توالی ها و ساختارهای بیولوژیکی و تفسیر اطلاعات از آن ها به علم بیوانفورماتیک شهرت دارد. امروزه، حجم بالای داده در پزشکی و ژنتیک به منظور به دست آوردن نتایج و الگوهای مفید در رابطه با بیماری ها جمع آوری می شود. آنفولانزا یک بیماری شدیدا مسری، حاد و تب زای تنفسی است. این بیماری توسط ویروس آنفولانزا ایجاد می شود که یک ویروس هشت قسمتی است. آنفولانزا نوع a با توجه به آنتی ژن های سطحی آن هماگلوتینین و نورامینیداس به زیرگروه هایی تقسیم می شود. آزمایشات آنتی ژنی مرسوم در این زمینه زمانبر و پر هزینه بوده و اغلب کاملا دقیق نیستند. آنفولانزا در میزبان انسانی اش شیوع بسیار زیادی داشته است. با اندک تغییری در هر یک از آنتی ژن ها ویروس جدیدی به وجود می آید که واکسن فعلی کارائی خوبی در برابر آن نخواهد داشت، لذا سالانه نیاز به بازنگری در ترکیب واکسن وجود دارد تا ترکیب واکسن در نقاط متغیر بروزرسانی شود. استخراج دقیق نقاط متغیر و ثابت از اهمیت بسزایی برخوردار است. در این تحقیق، ابتدا با استفاده از تکنیک طبقه بندی الگوی دقیق پیش بینی زیرگروه ویروس جدید و میزبان آن بر اساس توالی های نوکلئتیدی و پروتئینی هماگلوتینین و نورامینیداس به دست آمد. سپس با استفاده از تکنیک طبقه بندی بر مبنای قوانین انجمنی، قوانین دقیق حاکم بر زیرگروه ویروس استخراج شد. در ادامه تحقیق، نقاط متغیر ویروس در اثر جهش-های آنتی ژنی رخداده در پاندامی های گذشته و نقاط تاثیرگذار در ظهور زیرگروه های جدید استخراج شد. این نقاط در طراحی واکسن آنفولانزا و به منظور بالا بردن کارایی آن قابل استفاده است.

similar resources

مروری بر: ارزیابی پویایی تکثیر ویروس های آنفلوانزا و برهم کنش های میزبان-ویروس

زمینه و هدف: آلودگی مستقیم انسان با ویروس های آنفلوانزای پرندگان دارای گیرنده های اختصاصی ویروس های انسانی، تهدیدی برای پیدایش یک ویروس نوپدید است که می تواند مسوول بروز جهان گیری باشد. پردازش توالی هماگلوتینین ویروس های آنفلوانزای پرندگان سال های اخیر و گلیکان های آن ها، بیان گر تمایل این ویروس ها به گیرنده های اسید سیالیکی انسانی است. تنظیم بالادست ژن های سایتوکاین های پیش التهابی و اینترفرون...

full text

شناسایی ویروس های آنفولانزا h۱n۱ فصلی و h۳n۲ به روشrt-pcr در همه گیری آنفولانزا در استان گلستان(سال ۱۳۸۸)

چکیده زمینه و هدف: ظهور آنفولانزای a جدید h1n1 با منشأ حیوانی که توانایی انتقال از انسان به انسان را داشته باشد، یکی از عوامل ایجاد نگرانی در رابطه با همه گیری آن شده است. در حال حاضر، ویروس های آنفولانزایی که فصلی میان انسان ها منتشر می شوند ویروس آنفولانزای a و زیرمجموعه هایh1n1,h3n2 و نیز ویروس آنفولانزای b‏ می باشند. هدف از این مطالعه شناسایی زیرمجموعه h3n2 و نوع جدید h1n1 (فصلی)از بیماران ...

full text

کلونینگ ژن پروتئین F ویروس نیوکاسل و تعیین توالی آن

ویروس عامل بیماری نیوکاسل (NDV) یکی از مهمترین عوامل بیماری های ویروسی طیور می باشد ، که سبب واگیری و مرگ ومیر شدید در طیور و گونه های متعددی از پرندگان می شود.پروتئین F ویروس جهت نفوذ و تکثیر ویروسی در حیوانات آلوده نقش محوری دارد. کلونینگ و بیان ژنوم کد کننده پروتئین F جهت تولید واکسن تحت واحد و همجچنین تولید آنتی بادی مونوکلنال علیه پروتئین F می تواند گتمهای جدیدیبرای شناسایی و پیشگیری از بی...

full text

کلونینگ و توالی یابی ژن m2 از ویروس a آنفولانزا سویه h9n2 وانتقال آن به وکتور بیانی pegfp-n1

چکیده بارزترین نقش پروتئین m2 در ویروس a آنفولانزا ایجاد یک کانال یونی یکطرفه برای عبور h+ به درون ویروس می باشد. این قابلیت در اسیدی شدن محتویات ویروس و رها سازی ژنوم آن به درون سیتوپلاسم میزبان نقش داشته و امری حیاتی برای تکثیر ویروس به شمار می رود. بر اساس شواهد، انسداد این کانال از تأثیر ویروس بر سلول میزبان جلوگیری کرده و مانع بیماریزایی آن می شود. با توجه به اهمیت این پروتئین کانالی در ا...

15 صفحه اول

انتقال و میزبان های طبیعی ویروس پیچیدگی برگ شلغم

ویروس پیچیدگی برگ شلغم (turnip curly top virus, tctv) یک جمینی ویروس جدید است که اخیراً از مزارع شلغم استان فارس گزارش شده است. از آنجا که این ویروس از نظر سازمان­دهی ژنوم از سایر جمینی ویروس­ها متفاوت است، هنوز بسیاری از ویژگی­های بیولوژیکی آن از جمله ناقل و سایر میزبان­های طبیعی آن مورد مطالعه قرار نگرفته است. به منظور شناسایی ناقل tctv در شرایط آزمایشگاهی، توانایی زنجرک­های circulifer haemato...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023